Hoewel de ATAG Neoz veel sterke punten heeft, zijn er ook duidelijke beperkingen die sommige gebruikers kunnen afschrikken. Ten eerste is de thermostaat een merkgebonden apparaat: het communicatieprotocol werkt primair met ATAG-ketels. Dit betekent dat als je een multi-fabrikant of open smart home-opstelling wilt (met integraties naar Alexa, Google Assistant, HomeKit of IFTTT), de Neoz niet geschikt is. Er is geen ondersteuning voor die ecosystemen, waardoor de Neoz minder aantrekkelijk is voor consumenten die hun huisbreed verbonden willen hebben.
Een ander aandachtspunt is de beperkte contactbelasting en lage spanningsgrenzen (max. 0,04 A en 24 V). Dat duidt erop dat de uitgangen elektronische signalen sturen en niet direct geschikt zijn voor het schakelen van bijvoorbeeld pompen of zonekleppen zonder extra relais of interfaces. Installateurs moeten daarom vaak aanvullende componenten inbouwen of een compatible ATAG-regeling gebruiken, wat extra kosten en werk kan betekenen bij retrofitprojecten.
Daarnaast biedt de Neoz geen externe ruimtevoeler aansluiting en heeft hij een IP30-classificatie, waardoor hij alleen voor droge, binnenliggende plaatsen geschikt is. Voor gebruikers die extra flexibiliteit of uitgebreide smart functies verwachten, zal de beperkte openbaarheid en integratiemogelijkheden als een nadeel ervaren worden.